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Section of Genetics - Genetic Cancer Susceptibility Group

Recent Publications - 12 most recent publications

1. Golozar A., Etemadi A., Kamangar F., Fazeltabar Malekshah A., Islami F., Nasrollahzadeh D., Abedi-Ardekani B., Khoshnia M., Pourshams A., Semnani S., Marjani H. A., Shakeri R., Sotoudeh M., Brennan P., Taylor P., Boffetta P., Abnet C., Dawsey S., Malekzadeh R. (2016) Food preparation methods, drinking water source, and esophageal squamous cell carcinoma in the high-risk area of Golestan, Northeast Iran European Journal of Cancer Prevention; 25(2):123-9. PMID: 25851181

2. Lorenz S., Baroy T., Sun J., Nome T., Vodak D., Bryne J. C., Hakelien A. M., Fernandez-Cuesta L., Mohlendick B., Rieder H., Szuhai K., Zaikova O., Ahlquist T. C., Thomassen G. O., Skotheim R. I., Lothe R. A., Tarpey P. S., Campbell P., Flanagan A., Myklebost O., Meza-Zepeda L. A. (2016) Unscrambling the genomic chaos of osteosarcoma reveals extensive transcript fusion, recurrent rearrangements and frequent novel TP53 aberrations Oncotarget; 7(5):5273-88. PMID: 26672768

3. Ormond L., Foll M., Ewing G. B., Pfeifer S. P., Jensen J. D. (2016) Inferring the age of a fixed beneficial allele Molecular Ecology; 25(1):157-169. PMID: 26576754

4. Kachuri L., Amos C. I., McKay J. D., Johansson M., Vineis P., Bueno-de-Mesquita H. B., Boutron-Ruault M. C., Johansson M., Quiros J. R., Sieri S., Travis R. C., Weiderpass E., Le Marchand L., Henderson B. E., Wilkens L., Goodman G. E., Chen C., Doherty J. A., Christiani D. C., Wei Y., Su L., Tworoger S., Zhang X., Kraft P., Zaridze D., Field J. K., Marcus M. W., Davies M. P., Hyde R., Caporaso N. E., Landi M. T., Severi G., Giles G. G., Liu G., McLaughlin J. R., Li Y., Xiao X., Fehringer G., Zong X., Denroche R. E., Zuzarte P. C., McPherson J. D., Brennan P., Hung R. J. (2016) Fine mapping of chromosome 5p15.33 based on a targeted deep sequencing and high density genotyping identifies novel lung cancer susceptibility loci Carcinogenesis; 37(1):96-105. PMID: 26590902

5. Fernandez-Cuesta L., McKay J. D. (2016) Genomic architecture of lung cancers Current Opinion in Oncology; 28(1):52-7. PMID: 26569422

6. Bei J. X., Su W. H., Ng C. C., Yu K., Chin Y. M., Lou P. J., Hsu W. L., McKay J. D., Chen C. J., Chang Y. S., Chen L. Z., Chen M. Y., Cui Q., Feng F. T., Feng Q. S., Guo Y. M., Jia W. H., Khoo A. S., Liu W. S., Mo H. Y., Pua K. C., Teo S. H., Tse K. P., Xia Y. F., Zhang H., Zhou G. Q., Liu J. J., Zeng Y. X., Hildesheim A. (2016) A GWAS Meta-analysis and Replication Study Identifies a Novel Locus within CLPTM1L/TERT Associated with Nasopharyngeal Carcinoma in Individuals of Chinese Ancestry Cancer Epidemiology, Biomarkers and Prevention; 25(1):188-92. PMID: 26545403

7. Wang Y., Wei Y., Gaborieau V., Shi J., Han Y., Timofeeva M. N., Su L., Li Y., Eisen T., Amos C. I., Landi M. T., Christiani D. C., McKay J. D., Houlston R. S. (2015) Deciphering associations for lung cancer risk through imputation and analysis of 12 316 cases and 16 831 controls European Journal of Human Genetics; 23(12):1723-8. PMID: 25804397

8. Sampson J. N., Wheeler W. A., Yeager M., Panagiotou O., Wang Z., Berndt S. I., Lan Q., Abnet C. C., Amundadottir L. T., Figueroa J. D., Landi M. T., Mirabello L., Savage S. A., Taylor P. R., Vivo I. D., McGlynn K. A., Purdue M. P., Rajaraman P., Adami H. O., Ahlbom A., Albanes D., Amary M. F., An S. J., Andersson U., Andriole G. Jr., Andrulis I. L., Angelucci E., Ansell S. M., Arici C., Armstrong B. K., Arslan A. A., Austin M. A., Baris D., Barkauskas D. A., Bassig B. A., Becker N., Benavente Y., Benhamou S., Berg C., Van Den Berg D., Bernstein L., Bertrand K. A., Birmann B. M., Black A., Boeing H., Boffetta P., Boutron-Ruault M. C., Bracci P. M., Brinton L., Brooks-Wilson A. R., Bueno-de-Mesquita H. B., Burdett L., Buring J., Butler M. A., Cai Q., Cancel-Tassin G., Canzian F., Carrato A., Carreon T., Carta A., Chan J. K., Chang E. T., Chang G. C., Chang I. S., Chang J., Chang-Claude J., Chen C. J., Chen C. Y., Chen C., Chen C. H., Chen C., Chen H., Chen K., Chen K. Y., Chen K. C., Chen Y., Chen Y. H., Chen Y. S., Chen Y. M., Chien L. H., Chirlaque M. D., Choi J. E., Choi Y. Y., Chow W. H., Chung C. C., Clavel J., Clavel-Chapelon F., Cocco P., Colt J. S., Comperat E., Conde L., Connors J. M., Conti D., Cortessis V. K., Cotterchio M., Cozen W., Crouch S., Crous-Bou M., Cussenot O., Davis F. G., Ding T., Diver W. R., Dorronsoro M., Dossus L., Duell E. J., Ennas M. G., Erickson R. L., Feychting M., Flanagan A. M., Foretova L., Fraumeni J. F. Jr., Freedman N. D., Beane Freeman L. E., Fuchs C., Gago-Dominguez M., Gallinger S., Gao Y. T., Gapstur S. M., Garcia-Closas M., Garcia-Closas R., Gascoyne R. D., Gastier-Foster J., Gaudet M. M., Gaziano J. M., Giffen C., Giles G. G., Giovannucci E., Glimelius B., Goggins M., Gokgoz N., Goldstein A. M., Gorlick R., Gross M., Grubb R. 3rd, Gu J., Guan P., Gunter M., Guo H., Habermann T. M., Haiman C. A., Halai D., Hallmans G., Hassan M., Hattinger C., He Q., He X., Helzlsouer K., Henderson B., Henriksson R., Hjalgrim H., Hoffman-Bolton J., Hohensee C., Holford T. R., Holly E. A., Hong Y. C., Hoover R. N., Horn-Ross P. L., Hosain G. M., Hosgood H. D. 3rd, Hsiao C. F., Hu N., Hu W., Hu Z., Huang M. S., Huerta J. M., Hung J. Y., Hutchinson A., Inskip P. D., Jackson R. D., Jacobs E. J., Jenab M., Jeon H. S., Ji B. T., Jin G., Jin L., Johansen C., Johnson A., Jung Y. J., Kaaks R., Kamineni A., Kane E., Kang C. H., Karagas M. R., Kelly R. S., Khaw K. T., Kim C., Kim H. N., Kim J. H., Kim J. S., Kim Y. H., Kim Y. T., Kim Y. C., Kitahara C. M., Klein A. P., Klein R. J., Kogevinas M., Kohno T., Kolonel L. N., Kooperberg C., Kricker A., Krogh V., Kunitoh H., Kurtz R. C., Kweon S. S., LaCroix A., Lawrence C., Lecanda F., Lee V. H., Li D., Li H., Li J., Li Y. J., Li Y., Liao L. M., Liebow M., Lightfoot T., Lim W. Y., Lin C. C., Lin D., Lindstrom S., Linet M. S., Link B. K., Liu C., Liu J., Liu L., Ljungberg B., Lloreta J., Lollo S. D., Lu D., Lund E., Malats N., Mannisto S., Marchand L. L., Marina N., Masala G., Mastrangelo G., Matsuo K., Maynadie M., McKay J., McKean-Cowdin R., Melbye M., Melin B. S., Michaud D. S., Mitsudomi T., Monnereau A., Montalvan R., Moore L. E., Mortensen L. M., Nieters A., North K. E., Novak A. J., Oberg A. L., Offit K., Oh I. J., Olson S. H., Palli D., Pao W., Park I. K., Park J. Y., Park K. H., Patino-Garcia A., Pavanello S., Peeters P. H., Perng R. P., Peters U., Petersen G. M., Picci P., Pike M. C., Porru S., Prescott J., Prokunina-Olsson L., Qian B., Qiao Y. L., Rais M., Riboli E., Riby J., Risch H. A., Rizzato C., Rodabough R., Roman E., Roupret M., Ruder A. M., Sanjose Sd, Scelo G., Schned A., Schumacher F., Schwartz K., Schwenn M., Scotlandi K., Seow A., Serra C., Serra M., Sesso H. D., Setiawan V. W., Severi G., Severson R. K., Shanafelt T. D., Shen H., Shen W., Shin M. H., Shiraishi K., Shu X. O., Siddiq A., Sierrasesumaga L., Sihoe A. D., Skibola C. F., Smith A., Smith M. T., Southey M. C., Spinelli J. J., Staines A., Stampfer M., Stern M. C., Stevens V. L., Stolzenberg-Solomon R. S., Su J., Su W. C., Sund M., Sung J. S., Sung S. W., Tan W., Tang W., Tardon A., Thomas D., Thompson C. A., Tinker L. F., Tirabosco R., Tjonneland A., Travis R. C., Trichopoulos D., Tsai F. Y., Tsai Y. H., Tucker M., Turner J., Vajdic C. M., Vermeulen R. C., Villano D. J., Vineis P., Virtamo J., Visvanathan K., Wactawski-Wende J., Wang C., Wang C. L., Wang J. C., Wang J., Wei F., Weiderpass E., Weiner G. J., Weinstein S., Wentzensen N., White E., Witzig T. E., Wolpin B. M., Wong M. P., Wu C., Wu G., Wu J., Wu T., Wu W., Wu X., Wu Y. L., Wunder J. S., Xiang Y. B., Xu J., Xu P., Yang P. C., Yang T. Y., Ye Y., Yin Z., Yokota J., Yoon H. I., Yu C. J., Yu H., Yu K., Yuan J. M., Zelenetz A., Zeleniuch-Jacquotte A., Zhang X. C., Zhang Y., Zhao X., Zhao Z., Zheng H., Zheng T., Zheng W., Zhou B., Zhu M., Zucca M., Boca S. M., Cerhan J. R., Ferri G. M., Hartge P., Hsiung C. A., Magnani C., Miligi L., Morton L. M., Smedby K. E., Teras L. R., Vijai J., Wang S. S., Brennan P., Caporaso N. E., Hunter D. J., Kraft P., Rothman N., Silverman D. T., Slager S. L., Chanock S. J., Chatterjee N. (2015) Analysis of Heritability and Shared Heritability Based on Genome-Wide Association Studies for Thirteen Cancer Types Journal of the National Cancer Institute; 107(12):. PMID: 26464424

9. Delahaye-Sourdeix M., Urayama K. Y., Gaborieau V., Veenstra R., Foll M., Chabrier A., Benavente Y., Nieters A., Becker N., Foretova L., Maynadie M., Staines A., Smedby K. E., Glimelius I., Lightfoot T., Cocco P., Galan P., Vatten L. J., Duell E. J., Kiemeney L., Roman E., de Sanjose S., Lathrop M., Melbye M., Brennan P., Diepstra A., van den Berg A., Hjalgrim H., Jarrett R. F., McKay J. D. (2015) A Novel Risk Locus at 6p21.3 for Epstein-Barr Virus-Positive Hodgkin Lymphoma Cancer Epidemiology, Biomarkers and Prevention; 24(12):1838-43. PMID: 26404960

10. Castells X., Karanovic S., Ardin M., Tomic K., Xylinas E., Durand G., Villar S., Forey N., Le Calvez-Kelm F., Voegele C., Karlovic K., Misic M., Dittrich D., Dolgalev I., McKay J., Shariat S. F., Sidorenko V. S., Fernandes A., Heguy A., Dickman K. G., Olivier M., Grollman A. P., Jelakovic B., Zavadil J. (2015) Low-Coverage Exome Sequencing Screen in Formalin-Fixed Paraffin-Embedded Tumors Reveals Evidence of Exposure to Carcinogenic Aristolochic Acid Cancer Epidemiology, Biomarkers and Prevention; 24(12):1873-81. PMID: 26383547

11. Ji X., Gui J., Han Y., Brennan P., Li Y., McKay J., Caporaso N. E., Bertazzi P. A., Landi M. T., Amos C. I. (2015) The role of haplotype in 15q25.1 locus in lung cancer risk: results of scanning chromosome 15 Carcinogenesis; 36(11):1275-83. PMID: 26282330

12. Brenner D. R., Amos C. I., Brhane Y., Timofeeva M. N., Caporaso N., Wang Y., Christiani D. C., Bickeboller H., Yang P., Albanes D., Stevens V. L., Gapstur S., McKay J., Boffetta P., Zaridze D., Szeszenia-Dabrowska N., Lissowska J., Rudnai P., Fabianova E., Mates D., Bencko V., Foretova L., Janout V., Krokan H. E., Skorpen F., Gabrielsen M. E., Vatten L., Njolstad I., Chen C., Goodman G., Lathrop M., Vooder T., Valk K., Nelis M., Metspalu A., Broderick P., Eisen T., Wu X., Zhang D., Chen W., Spitz M. R., Wei Y., Su L., Xie D., She J., Matsuo K., Matsuda F., Ito H., Risch A., Heinrich J., Rosenberger A., Muley T., Dienemann H., Field J. K., Raji O., Chen Y., Gosney J., Liloglou T., Davies M. P., Marcus M., McLaughlin J., Orlow I., Han Y., Li Y., Zong X., Johansson M., Liu G., Tworoger S. S., Le Marchand L., Henderson B. E., Wilkens L. R., Dai J., Shen H., Houlston R. S., Landi M. T., Brennan P., Hung R. J. (2015) Identification of lung cancer histology-specific variants applying Bayesian framework variant prioritization approaches within the TRICL and ILCCO consortia Carcinogenesis; 36(11):1314-26. PMID: 26363033