Research Groups

Section of Genetics - Genetic Cancer Susceptibility Group

Previous Publications - All Publications 2013-2014

1. Bonora E., Rizzato C., Diquigiovanni C., Oudot-Mellakh T., Campa D., Vargiolu M., Guedj M., McKay J.D., Romeo G., Canzian F., Lesueur F. (2014) The FOXE1 locus is a major genetic determinant for familial nonmedullary thyroid carcinoma International journal of cancer; 134(9):2098-2107. PMID: 24127282

2. Damiola F., Byrnes G., Moissonnier M., Pertesi M., Deltour I., Fillon A., Le Calvez-Kelm F., Tenet V., McKay-Chopin S., McKay J.D., Malakhova I., Masyakin V., Cardis E., Lesueur F., Kesminiene A. (2014) Contribution of ATM and FOXE1 (TTF2) to risk of papillary thyroid carcinoma in Belarusian children exposed to radiation International journal of cancer; 134(7):1659-1668. PMID: 24105688

3. Anantharaman D., Chabrier A., Gaborieau V., Franceschi S., Herrero R., Rajkumar T., Samant T., Mahimkar M.B., Brennan P., McKay J.D. (2014) Genetic variants in nicotine addiction and alcohol metabolism genes, oral cancer risk and the propensity to smoke and drink alcohol: a replication study in India PLoS ONE; 9(2):e88240. PMID: 24505444

4. Meyer K.B., O'Reilly M., Michailidou K., Carlebur S., Edwards S.L., French J.D., Prathalingham R., Dennis J., Bolla M.K., Wang Q., de Santiago I, Hopper J.L., Tsimiklis H., Apicella C., Southey M.C., Schmidt M.K., Broeks A., Van 't Veer L.J., Hogervorst F.B., Muir K., Lophatananon A., Stewart-Brown S., Siriwanarangsan P., Fasching P.A., Lux M.P., Ekici A.B., Beckmann M.W., Peto J., Dos Santos Silva I, Fletcher O., Johnson N., Sawyer E.J., Tomlinson I., Kerin M.J., Miller N., Marme F., Schneeweiss A., Sohn C., Burwinkel B., Guenel P., Truong T., Laurent-Puig P., Menegaux F., Bojesen S.E., Nordestgaard B.G., Nielsen S.F., Flyger H., Milne R.L., Zamora M.P., Arias J.I., Benitez J., Neuhausen S., Anton-Culver H., Ziogas A., Dur C.C., Brenner H., Muller H., Arndt V., Stegmaier C., Meindl A., Schmutzler R.K., Engel C., Ditsch N., Brauch H., Bruning T., Ko Y.D., Nevanlinna H., Muranen T.A., Aittomaki K., Blomqvist C., Matsuo K., Ito H., Iwata H., Yatabe Y., Dork T., Helbig S., Bogdanova N.V., Lindblom A., Margolin S., Mannermaa A., Kataja V., Kosma V.M., Hartikainen J.M., Chenevix-Trench G., Wu A.H., Tseng C.C., Van Den Berg D., Stram D.O., Lambrechts D., Thienpont B., Christiaens M.R., Smeets A., Chang-Claude J., Rudolph A., Seibold P., Flesch-Janys D., Radice P., Peterlongo P., Bonanni B., Bernard L., Couch F.J., Olson J.E., Wang X., Purrington K., Giles G.G., Severi G., Baglietto L., McLean C., Haiman C.A., Henderson B.E., Schumacher F., Le Marchand L., Simard J., Goldberg M.S., Labreche F., Dumont M., Teo S.H., Yip C.H., Phuah S.Y., Kristensen V., Grenaker Alnaes G., Borresen-Dale A.L., Zheng W., Deming-Halverson S., Shrubsole M., Long J., Winqvist R., Pylkas K., Jukkola-Vuorinen A., Kauppila S., Andrulis I.L., Knight J.A., Glendon G., Tchatchou S., Devilee P., Tollenaar R.A., Seynaeve C.M., Garcia-Closas M., Figueroa J., Chanock S.J., Lissowska J., Czene K., Darabi H., Eriksson K., Hooning M.J., Martens J.W., van den Ouweland A.M., van Deurzen C.H., Hall P., Li J., Liu J., Humphreys K., Shu X.O., Lu W., Gao Y.T., Cai H., Cox A., Reed M.W., Blot W., Signorello L.B., Cai Q., Pharoah P.D., Ghoussaini M., Harrington P., Tyrer J., Kang D., Choi J.Y., Park S.K., Noh D.Y., Hartman M., Hui M., Lim W.Y., Buhari S.A., Hamann U., Forsti A., Rudiger T., Ulmer H.U., Jakubowska A., Lubinski J., Jaworska K., Durda K., Sangrajrang S., Gaborieau V., Brennan P., McKay J., Vachon C., Slager S., Fostira F., Pilarski R., Shen C.Y., Hsiung C.N., Wu P.E., Hou M.F., Swerdlow A., Ashworth A., Orr N., Schoemaker M.J., Ponder B.A., Dunning A.M., Easton D.F. (2013) Fine-Scale Mapping of the FGFR2 Breast Cancer Risk Locus: Putative Functional Variants Differentially Bind FOXA1 and E2F1 Am.J Hum Genet.; 93(6):1046-1060. PMID: 24290378

5. Ortiz-Cuaran S., Cox D., Villar S., Friesen M.D., Durand G., Chabrier A., Khuhaprema T., Sangrajrang S., Ognjanovic S., Groopman J.D., Hainaut P., Le Calvez-Kelm F. (2013) Association between TP53 R249S mutation and polymorphisms in TP53 intron 1 in hepatocellular carcinoma Genes Chromosomes.Cancer; 52(10):912-919. PMID: 23836507

6. Berndt S.I., Skibola C.F., Joseph V., Camp N.J., Nieters A., Wang Z., Cozen W., Monnereau A., Wang S.S., Kelly R.S., Lan Q., Teras L.R., Chatterjee N., Chung C.C., Yeager M., Brooks-Wilson A.R., Hartge P., Purdue M.P., Birmann B.M., Armstrong B.K., Cocco P., Zhang Y., Severi G., Zeleniuch-Jacquotte A., Lawrence C., Burdette L., Yuenger J., Hutchinson A., Jacobs K.B., Call T.G., Shanafelt T.D., Novak A.J., Kay N.E., Liebow M., Wang A.H., Smedby K.E., Adami H.O., Melbye M., Glimelius B., Chang E.T., Glenn M., Curtin K., Cannon-Albright L.A., Jones B., Diver W.R., Link B.K., Weiner G.J., Conde L., Bracci P.M., Riby J., Holly E.A., Smith M.T., Jackson R.D., Tinker L.F., Benavente Y., Becker N., Boffetta P., Brennan P., Foretova L., Maynadie M., McKay J., Staines A., Rabe K.G., Achenbach S.J., Vachon C.M., Goldin L.R., Strom S.S., Lanasa M.C., Spector L.G., Leis J.F., Cunningham J.M., Weinberg J.B., Morrison V.A., Caporaso N.E., Norman A.D., Linet M.S., De Roos A.J., Morton L.M., Severson R.K., Riboli E., Vineis P., Kaaks R., Trichopoulos D., Masala G., Weiderpass E., Chirlaque M.D., Vermeulen R.C., Travis R.C., Giles G.G., Albanes D., Virtamo J., Weinstein S., Clavel J., Zheng T., Holford T.R., Offit K., Zelenetz A., Klein R.J., Spinelli J.J., Bertrand K.A., Laden F., Giovannucci E., Kraft P., Kricker A., Turner J., Vajdic C.M., Ennas M.G., Ferri G.M., Miligi L., Liang L., Sampson J., Crouch S., Park J.H., North K.E., Cox A., Snowden J.A., Wright J., Carracedo A., Lopez-Otin C., Bea S., Salaverria I., Martin-Garcia D., Campo E., Fraumeni J.F. Jr., de Sanjose S., Hjalgrim H., Cerhan J.R., Chanock S.J., Rothman N., Slager S.L. (2013) Genome-wide association study identifies multiple risk loci for chronic lymphocytic leukemia Nat.Genet.; 45(8):868-876. PMID: 23770605

7. Voegele C., Bouchereau B., Robinot N., McKay J., Damiecki P., Alteyrac L. (2013) A universal open-source Electronic Laboratory Notebook Bioinformatics.; 29(13):1710-1712. PMID: 23645817

8. Chen D., Juko-Pecirep I., Hammer J., Ivansson E., Enroth S., Gustavsson I., Feuk L., Magnusson P.K., McKay J.D., Wilander E., Gyllensten U. (2013) Genome-wide association study of susceptibility loci for cervical cancer Journal of the National Cancer Institute; 105(9):624-633. PMID: 23482656

9. Shakeri R., Malekzadeh R., Etemadi A., Nasrollahzadeh D., Abedi-Ardekani B., Khoshnia M., Islami F., Pourshams A., Pawlita M., Boffetta P., Dawsey S.M., Kamangar F., Abnet C.C. (2013) Association of tooth loss and oral hygiene with risk of gastric adenocarcinoma Cancer Prev Res.(Phila); 6(5):477-482. PMID: 23503651

10. Bojesen S.E., Pooley K.A., Johnatty S.E., Beesley J., Michailidou K., Tyrer J.P., Edwards S.L., Pickett H.A., Shen H.C., Smart C.E., Hillman K.M., Mai P.L., Lawrenson K., Stutz M.D., Lu Y., Karevan R., Woods N., Johnston R.L., French J.D., Chen X., Weischer M., Nielsen S.F., Maranian M.J., Ghoussaini M., Ahmed S., Baynes C., Bolla M.K., Wang Q., Dennis J., McGuffog L., Barrowdale D., Lee A., Healey S., Lush M., Tessier D.C., Vincent D., Bacot F., Vergote I., Lambrechts S., Despierre E., Risch H.A., Gonzalez-Neira A., Rossing M.A., Pita G., Doherty J.A., Alvarez N., Larson M.C., Fridley B.L., Schoof N., Chang-Claude J., Cicek M.S., Peto J., Kalli K.R., Broeks A., Armasu S.M., Schmidt M.K., Braaf L.M., Winterhoff B., Nevanlinna H., Konecny G.E., Lambrechts D., Rogmann L., Guenel P., Teoman A., Milne R.L., Garcia J.J., Cox A., Shridhar V., Burwinkel B., Marme F., Hein R., Sawyer E.J., Haiman C.A., Wang-Gohrke S., Andrulis I.L., Moysich K.B., Hopper J.L., Odunsi K., Lindblom A., Giles G.G., Brenner H., Simard J., Lurie G., Fasching P.A., Carney M.E., Radice P., Wilkens L.R., Swerdlow A., Goodman M.T., Brauch H., Garcia-Closas M., Hillemanns P., Winqvist R., Durst M., Devilee P., Runnebaum I., Jakubowska A., Lubinski J., Mannermaa A., Butzow R., Bogdanova N.V., Dork T., Pelttari L.M., Zheng W., Leminen A., nton-Culver H., Bunker C.H., Kristensen V., Ness R.B., Muir K., Edwards R., Meindl A., Heitz F., Matsuo K., du Bois A., Wu A.H., Harter P., Teo S.H., Schwaab I., Shu X.O., Blot W., Hosono S., Kang D., Nakanishi T., Hartman M., Yatabe Y., Hamann U., Karlan B.Y., Sangrajrang S., Kjaer S.K., Gaborieau V., Jensen A., Eccles D., Hogdall E., Shen C.Y., Brown J., Woo Y.L., Shah M., Azmi M.A., Luben R., Omar S.Z., Czene K., Vierkant R.A., Nordestgaard B.G., Flyger H., Vachon C., Olson J.E., Wang X., Levine D.A., Rudolph A., Weber R.P., Flesch-Janys D., Iversen E., Nickels S., Schildkraut J.M., Silva Idos S., Cramer D.W., Gibson L., Terry K.L., Fletcher O., Vitonis A.F., van der Schoot C.E., Poole E.M., Hogervorst F.B., Tworoger S.S., Liu J., Bandera E.V., Li J., Olson S.H., Humphreys K., Orlow I., Blomqvist C., Rodriguez-Rodriguez L., Aittomaki K., Salvesen H.B., Muranen T.A., Wik E., Brouwers B., Krakstad C., Wauters E., Halle M.K., Wildiers H., Kiemeney L.A., Mulot C., Aben K.K., Laurent-Puig P., Altena A.M., Truong T., Massuger L.F., Benitez J., Pejovic T., Perez J.I., Hoatlin M., Zamora M.P., Cook L.S., Balasubramanian S.P., Kelemen L.E., Schneeweiss A., Le N.D., Sohn C., Brooks-Wilson A., Tomlinson I., Kerin M.J., Miller N., Cybulski C., Henderson B.E., Menkiszak J., Schumacher F., Wentzensen N., Le Marchand L., Yang H.P., Mulligan A.M., Glendon G., Engelholm S.A., Knight J.A., Hogdall C.K., Apicella C., Gore M., Tsimiklis H., Song H., Southey M.C., Jager A., den Ouweland A.M., Brown R., Martens J.W., Flanagan J.M., Kriege M., Paul J., Margolin S., Siddiqui N., Severi G., Whittemore A.S., Baglietto L., McGuire V., Stegmaier C., Sieh W., Muller H., Arndt V., Labreche F., Gao Y.T., Goldberg M.S., Yang G., Dumont M., McLaughlin J.R., Hartmann A., Ekici A.B., Beckmann M.W., Phelan C.M., Lux M.P., Permuth-Wey J., Peissel B., Sellers T.A., Ficarazzi F., Barile M., Ziogas A. (2013) Multiple independent variants at the TERT locus are associated with telomere length and risks of breast and ovarian cancer Nature genetics; 45(4):371-384, e1-e2. PMID: 23535731

11. French J.D., Ghoussaini M., Edwards S.L., Meyer K.B., Michailidou K., Ahmed S., Khan S., Maranian M.J., O'Reilly M., Hillman K.M., Betts J.A., Carroll T., Bailey P.J., Dicks E., Beesley J., Tyrer J., Maia A.T., Beck A., Knoblauch N.W., Chen C., Kraft P., Barnes D., Gonzalez-Neira A., Alonso M.R., Herrero D., Tessier D.C., Vincent D., Bacot F., Luccarini C., Baynes C., Conroy D., Dennis J., Bolla M.K., Wang Q., Hopper J.L., Southey M.C., Schmidt M.K., Broeks A., Verhoef S., Cornelissen S., Muir K., Lophatananon A., Stewart-Brown S., Siriwanarangsan P., Fasching P.A., Loehberg C.R., Ekici A.B., Beckmann M.W., Peto J., Dos Santos Silva I, Johnson N., Aitken Z., Sawyer E.J., Tomlinson I., Kerin M.J., Miller N., Marme F., Schneeweiss A., Sohn C., Burwinkel B., Guenel P., Truong T., Laurent-Puig P., Menegaux F., Bojesen S.E., Nordestgaard B.G., Nielsen S.F., Flyger H., Milne R.L., Zamora M.P., rias Perez J.I., Benitez J., nton-Culver H., Brenner H., Muller H., Arndt V., Stegmaier C., Meindl A., Lichtner P., Schmutzler R.K., Engel C., Brauch H., Hamann U., Justenhoven C., Aaltonen K., Heikkila P., Aittomaki K., Blomqvist C., Matsuo K., Ito H., Iwata H., Sueta A., Bogdanova N.V., Antonenkova N.N., Dork T., Lindblom A., Margolin S., Mannermaa A., Kataja V., Kosma V.M., Hartikainen J.M., Wu A.H., Tseng C.C., Van Den Berg D., Stram D.O., Lambrechts D., Peeters S., Smeets A., Floris G., Chang-Claude J., Rudolph A., Nickels S., Flesch-Janys D., Radice P., Peterlongo P., Bonanni B., Sardella D., Couch F.J., Wang X., Pankratz V.S., Lee A., Giles G.G., Severi G., Baglietto L., Haiman C.A., Henderson B.E., Schumacher F., Le Marchand L., Simard J., Goldberg M.S., Labreche F., Dumont M., Teo S.H., Yip C.H., Ng C.H., Vithana E.N., Kristensen V., Zheng W., ming-Halverson S., Shrubsole M., Long J., Winqvist R., Pylkas K., Jukkola-Vuorinen A., Grip M., Andrulis I.L., Knight J.A., Glendon G., Mulligan A.M., Devilee P., Seynaeve C., Garcia-Closas M., Figueroa J., Chanock S.J., Lissowska J., Czene K., Klevebring D., Schoof N., Hooning M.J., Martens J.W., Collee J.M., Tilanus-Linthorst M., Hall P., Li J., Liu J., Humphreys K., Shu X.O., Lu W., Gao Y.T., Cai H., Cox A., Balasubramanian S.P., Blot W., Signorello L.B., Cai Q., Pharoah P.D., Healey C.S., Shah M., Pooley K.A., Kang D., Yoo K.Y., Noh D.Y., Hartman M., Miao H., Sng J.H., Sim X., Jakubowska A., Lubinski J., Jaworska-Bieniek K., Durda K., Sangrajrang S., Gaborieau V., McKay J., Toland A.E., Ambrosone C.B., Yannoukakos D., Godwin A.K., Shen C.Y., Hsiung C.N., Wu P.E., Chen S.T., Swerdlow A., Ashworth A., Orr N., Schoemaker M.J., Ponder B.A., Nevanlinna H., Brown M.A., Chenevix-Trench G., Easton D.F., Dunning A.M. (2013) Functional variants at the 11q13 risk locus for breast cancer regulate cyclin D1 expression through long-range enhancers American journal of human genetics; 92(4):489-503. PMID: 23540573

12. Michailidou K., Hall P., Gonzalez-Neira A., Ghoussaini M., Dennis J., Milne R.L., Schmidt M.K., Chang-Claude J., Bojesen S.E., Bolla M.K., Wang Q., Dicks E., Lee A., Turnbull C., Rahman N., Fletcher O., Peto J., Gibson L., Dos Santos Silva I, Nevanlinna H., Muranen T.A., Aittomaki K., Blomqvist C., Czene K., Irwanto A., Liu J., Waisfisz Q., Meijers-Heijboer H., Adank M., van der Luijt R.B., Hein R., Dahmen N., Beckman L., Meindl A., Schmutzler R.K., Muller-Myhsok B., Lichtner P., Hopper J.L., Southey M.C., Makalic E., Schmidt D.F., Uitterlinden A.G., Hofman A., Hunter D.J., Chanock S.J., Vincent D., Bacot F., Tessier D.C., Canisius S., Wessels L.F., Haiman C.A., Shah M., Luben R., Brown J., Luccarini C., Schoof N., Humphreys K., Li J., Nordestgaard B.G., Nielsen S.F., Flyger H., Couch F.J., Wang X., Vachon C., Stevens K.N., Lambrechts D., Moisse M., Paridaens R., Christiaens M.R., Rudolph A., Nickels S., Flesch-Janys D., Johnson N., Aitken Z., Aaltonen K., Heikkinen T., Broeks A., Veer L.J., van der Schoot C.E., Guenel P., Truong T., Laurent-Puig P., Menegaux F., Marme F., Schneeweiss A., Sohn C., Burwinkel B., Zamora M.P., Perez J.I., Pita G., Alonso M.R., Cox A., Brock I.W., Cross S.S., Reed M.W., Sawyer E.J., Tomlinson I., Kerin M.J., Miller N., Henderson B.E., Schumacher F., Le Marchand L., Andrulis I.L., Knight J.A., Glendon G., Mulligan A.M., Lindblom A., Margolin S., Hooning M.J., Hollestelle A., van den Ouweland A.M., Jager A., Bui Q.M., Stone J., Dite G.S., Apicella C., Tsimiklis H., Giles G.G., Severi G., Baglietto L., Fasching P.A., Haeberle L., Ekici A.B., Beckmann M.W., Brenner H., Muller H., Arndt V., Stegmaier C., Swerdlow A., Ashworth A., Orr N., Jones M., Figueroa J., Lissowska J., Brinton L., Goldberg M.S., Labreche F., Dumont M., Winqvist R., Pylkas K., Jukkola-Vuorinen A., Grip M., Brauch H., Hamann U., Bruning T., Radice P., Peterlongo P., Manoukian S., Bonanni B., Devilee P., Tollenaar R.A., Seynaeve C., van Asperen C.J., Jakubowska A., Lubinski J., Jaworska K., Durda K., Mannermaa A., Kataja V., Kosma V.M., Hartikainen J.M., Bogdanova N.V., Antonenkova N.N., Dork T., Kristensen V.N., nton-Culver H., Slager S., Toland A.E., Edge S., Fostira F., Kang D., Yoo K.Y., Noh D.Y., Matsuo K., Ito H., Iwata H., Sueta A., Wu A.H., Tseng C.C., Van Den Berg D., Stram D.O., Shu X.O., Lu W., Gao Y.T., Cai H., Teo S.H., Yip C.H., Phuah S.Y., Cornes B.K., Hartman M., Miao H., Lim W.Y., Sng J.H., Muir K., Lophatananon A., Stewart-Brown S., Siriwanarangsan P., Shen C.Y., Hsiung C.N., Wu P.E., Ding S.L., Sangrajrang S., Gaborieau V., Brennan P., McKay J., Blot W.J., Signorello L.B., Cai Q., Zheng W., Deming-Halverson S., Shrubsole M., Long J., Simard J., Garcia-Closas M., Pharoah P.D., Chenevix-Trench G., Dunning A.M., Benitez J., Easton D.F. (2013) Large-scale genotyping identifies 41 new loci associated with breast cancer risk Nature genetics; 45(4):353-2. PMID: 23535729

13. Accardi R., Fathallah I., Gruffat H., Mariggio G., Le Calvez-Kelm F., Voegele C., Bartosch B., Hernandez-Vargas H., McKay J., Sylla B.S., Manet E., Tommasino M. (2013) Epstein - Barr virus transforming protein LMP-1 alters B cells gene expression by promoting accumulation of the oncoprotein DeltaNp73alpha PLoS.Pathog.; 9(3):e1003186. PMID: 23516355

14. Martino A., Sainz J., Manuel Reis R., Moreno V., Buda G., Lesueur F., Marques H., Garcia-Sanz R., Rios R., Stein A., Dumontet C., Gemignani F., Maria Rossi A., Landi S., Jurado M., Petrini M., Jamroziak K., Campa D., Canzian F. (2013) Polymorphisms in regulators of xenobiotic transport and metabolism genes PXR and CAR do not affect multiple myeloma risk: a case-control study in the context of the IMMEnSE consortium J Hum Genet.; 58(3):155-159. PMID: 23303387

15. Henrion M., Frampton M., Scelo G., Purdue M., Ye Y., Broderick P., Ritchie A., Kaplan R., Meade A., McKay J., Johansson M., Lathrop M., Larkin J., Rothman N., Wang Z., Chow W.H., Stevens V.L., Ryan Diver W., Gapstur S.M., Albanes D., Virtamo J., Wu X., Brennan P., Chanock S., Eisen T., Houlston R.S. (2013) Common variation at 2q22.3 (ZEB2) influences the risk of renal cancer Hum.Mol.Genet.; 22(4):825-831. PMID: 23184150

16. Thompson B.A., Greenblatt M.S., Vallee M.P., Herkert J.C., Tessereau C., Young E.L., Adzhubey I.A., Li B., Bell R., Feng B., Mooney S.D., Radivojac P., Sunyaev S.R., Frebourg T., Hofstra R.M., Sijmons R.H., Boucher K., Thomas A., Goldgar D.E., Spurdle A.B., Tavtigian S.V. (2013) Calibration of multiple in silico tools for predicting pathogenicity of mismatch repair gene missense substitutions Hum Mutat.; 34(1):255-265. PMID: 22949387

17. Caboux E., Paciencia M., Durand G., Robinot N., Wozniak M.B., Galateau-Salle F., Byrnes G., Hainaut P., Le Calvez-Kelm F. (2013) Impact of delay to cryopreservation on RNA integrity and genome-wide expression profiles in resected tumor samples PLoS.One.; 8(11):e79826. PMID: 24278187

18. Ouzounova M., Vuong T., Ancey P.B., Ferrand M., Durand G., Le-Calvez Kelm F., Croce C., Matar C., Herceg Z., Hernandez-Vargas H. (2013) MicroRNA miR-30 family regulates non-attachment growth of breast cancer cells BMC.Genomics; 139. PMID: 23445407

19. Wozniak M.B., Le Calvez-Kelm F., Abedi-Ardekani B., Byrnes G., Durand G., Carreira C., Michelon J., Janout V., Holcatova I., Foretova L., Brisuda A., Lesueur F., McKay J., Brennan P., Scelo G. (2013) Integrative genome-wide gene expression profiling of clear cell renal cell carcinoma in Czech Republic and in the United States PLoS.One.; 8(3):e57886. PMID: 23526956